Eva Sánchez Cobos

Departamento

Química Física (Facultad de Ciencias)


Grupo de investigación

Biofísica y Biotecnología Molecular (FQM-171)

Sobre mí

Mi trabajo de investigación se ha centrado en el estudio biofísico, in vitro, de pequeñas proteínas y dominios modulares, así como la caracterización de su unión a ligandos de diseño, con el fin de lograr una mejor comprensión de las reglas que gobiernan su estabilidad y los mecanismos de plegamiento y unión a otras moléculas biológicas, cruciales para determinar la especificidad de dichos procesos de unión y las consecuentes implicaciones en el diseño racional de estrategias de búsqueda de inhibidores de estas interacciones con fines terapéuticos. Esto es relevante debido a la implicación de algunos de estos dominios estudiados (SH3, WW, PDZ) y sus interacciones en el desarrollo de diversas enfermedades humanas. Los objetivos de estas investigaciones se han alcanzado combinando aspectos termodinámicos, cinéticos, estructurales y dinámicos y usando una amplia serie de metodologías y técnicas, que abarcan desde el uso de herramientas de la biología molecular hasta técnicas calorimétricas (calorimetría diferencial de barrido (DSC), calorimetría Isoterma de titulación), espectroscópicas (dicroísmo circular) o cinéticas (flujo detenido, mezcla ultra-rápida y salto de temperatura).
De forma un poco más concreta, durante mi tesis doctoral se llevó a cabo la caracterización de la estabilidad y el mecanismo de plegamiento de pequeñas proteínas y dominios estructurales de las mismas, mediante desplegamiento térmico o en presencia de agentes desnaturalizantes. A lo largo de esta etapa predoctoral tuve la oportunidad de realizar diversas estancias en el laboratorio del Dr. Luis Serrano en el European Molecular Biology Laboratory (Heidelberg, Alemania). Posteriormente, durante mi etapa postdoctoral en el laboratorio de la Dra. Sheena Radford en la Universidad de Leeds (Reino Unido), la actividad realizada estuvo centrada en el estudio cinético de estados intermedios poblados durante el plegamiento de proteínas en presencia de agentes estabilizantes, con el propósito de caracterizar dicho proceso desde los estadios iniciales, hasta la formación del estado nativo, en las escalas temporales comprendidas entre el micro y milisegundo.
Tras mi reincorporación al departamento de Química Física, una vez finalizada mi etapa postdoctoral, he venido desarrollando mi investigación dentro de varias líneas de investigación, como la que se centra en el estudio termodinámico, estructural y dinámico de módulos de reconocimiento de secuencias ricas en prolina,
sus interacciones con ligandos y su aplicación al diseño racional de inhibidores con fines biotecnológicos. Otra
de las líneas se ha basado en el diseño, producción y caracterización biofísica de antígenos basados en la
proteína gp-41, relacionada con el proceso de fusión del HIV-1 a la membrana de la célula huésped, con el fin
de obtener inhibidores de la acción del virus y candidatos en el desarrollo de la vacuna contra el SIDA. Por
último, durante los últimos años también hemos venido trabajando en el análisis termodinámico y estructural de
dominios PDZ y en el estudio de la influencia del equilibrio conformacional e interacciones con ligandos en la
regulación de redes celulares de interacción proteína-proteína.
El fruto de estos estudios se plasma en la publicación de diferentes artículos en revistas internacionales,
así como la dirección de dos tesis doctorales y la supervisión de varios Trabajos Fin de Grado y Máster
respectivamente.

Líneas de investigación

Estudio termodinámico y cinético del plegamiento de proteínas. Interacciones proteína-ligando.

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